王拥军教授长期从事脑血管病病因与发病机制、关键防治技术与体系建立的相关研究。作为国家“十二五”、“十三五”脑血管病等重大慢病重点研发计划的首席科学家，在脑血管病病因和发病机制分型、脑血管病防控优化体系的建立等方面取得了多项系统性、创新性的研究成果，获得新药发明专利，改写了国际脑血管病防治指南与国内外教科书，并广泛应用于临床。在New England Journal of Medicine，JAMA，Circulation等杂志发表SCI期刊论文300余篇，被他引1000余次。其中，针对高危非致残性脑血管病的短程、早期、优化的抗血小板治疗新技术，被New England Journal of Medicine杂志评为“2013年度国际医学领域重大进展”，被Lancet Neurology评为“国际神经病学领域年度八大进展之一”。入选“万人计划”科技领军人才、“北京学者”、“京市高层次创新创业人才支持计划杰出人才”，获得国家科技进步二等奖、教育部科技进步一等奖、北京市科学进步一等奖、中华预防医学会科学技术一等奖、全国优秀科技工作者等多个奖项。带领团队获得科技部首批创新团队荣誉称号。