马士谦2003年获北京大学学士学位，2006年获中国科学院硕士学位，2011年在哥伦比亚大学进行工业工程和运营研究，获博士学位。然后他花了一年半时间在明尼苏达大学数学及其应用研究所担任NSF博士后研究员。马士谦于2012年12月加入香港中文大学系统工程与工程管理系。目前的研究兴趣包括大规模的优化理论和算法及其在大数据分析，统计学，机器学习，生物信息学，信号处理和图像处理。
马士谦2010年获得INFORMS优化协会最佳学生论文奖，2011年荣获INFORMS乔治·尼科尔森学生论文比赛。他是2011年的赫尔曼·金斯坦奖学金入围者之一。他于2016年获得运营研究会学报“中国优秀论文奖”。
