方晓红，1990年毕业于武汉大学化学系，获学士学位。1993年和1996年分别于北京大学化学系获硕士学位和博士学位。1997年4月至1998年3月在加拿大滑铁卢大学化学系做博士后。1998年4月至2001年12月先后在美国佛罗里达大学化学系、生物技术中心及生物/纳米技术交叉研究中心做博士后、研究助理。2001年4月入选中科院百人计划，2001年12月回国工作，任中国科学院化学研究所分子纳米结构与纳米技术重点实验室研究员，博士生导师，兼中科院研究生院教授。
在发展高灵敏度的生物医学分析新方法、单分子水平研究DNA/蛋白质相互作用力和对蛋白质等生物大分子表征、细胞信号转导相关蛋白的活细胞单分子研究等方面取得了高水平的研究成果。已在PNAS、Acc. Chem. Res.、JACS、Angew. Chem. Int. Ed.、Nano Lett. Nucl.Acid. Res.、Anal. Chem.、J. Phy. Chem. 等国际学术期刊上发表论文140多篇。主持和作为主要成员承担和完成了国家自然科学基金委杰出青年基金、重大、重点基金和国家科技部、卫生部等多项科研项目, 2007年任科技部纳米重大科学研究计划项目首席科学家， 2012年获得持续支持，再次任纳米重大科学研究计划项目首席科学家。
