主要从事酵母菌生物多样性、分子系统学和进化生物学以及酿造微生物组研究。在酵母菌资源调查、分类鉴定和菌种保藏的基础上，重点进行下述方面的研究：1) 酵母菌系统发育、物种分化与形成机制；2) 酿酒酵母菌群体遗传学和群体基因组学；3) 工业酵母菌优良发酵和抗逆性能的分子机制与遗传改造；4) 传统酿造微生物组学。 已发表酵母菌新纲3个、新目5个、新科20个、新属58个、新种190余个和新组合340余个；重建了酵母菌重要类群的分类系统；发现了白念珠菌致病类型、药物敏感性和基因型之间的对应性；确立了酿酒酵母菌的中国/东亚起源说和拉格啤酒酵母菌的青藏高原起源说。
已在国际核心(SCI)期刊发表研究论文近100篇。参与国际酵母菌系统学研究领域权威专著和工具书《The Yeasts, a Taxonomic Study》第5版(Elsevier，2011)的编著，并以共同主编身份，组织该工具书下一版的编著。
曾任中国科学院真菌学国家重点实验室副主任和国际微生物学会联盟(IUMS)真菌学部执委。现任中国菌物学会秘书长，国际酵母菌委员会委员，国际酵母菌系统学与命名委员会委员；国际食品真菌委员会委员；国际学术期刊《Mycoscience》《Yeast》《Mycology》和《Studies in Mycology》编辑或编委，《菌物学报》和《中国真菌学杂志》副主编，《微生物学报》、《菌物研究》和《生物学通报》等期刊编委。
工作简历
2013-01~2018-12,荷兰皇家艺术与科学院真菌多样性研究中心(CBS), 兼职研究员
2008-12~2009-03,日本千叶大学医学部, 客座教授
2002-01~2002-10,日本畜产草地研究所, JSPS Fellow
2000-10~现在, 中国科学院微生物研究所, 博士生导师
1999-11~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究员
1999-04~1999-10,日本理化学研究所, 研究员
1997-02~1997-08,日本理化学研究所, 研究员
1996-09~1999-10,中国科学院微生物研究所, 副研究员
社会兼职
2020-01-01-今,Studies in Mycology, 编委
2016-04-01-今,国际食品真菌委员会, 委员
2016-01-01-今,Yeast, 编辑
2015-07-01-今,中国菌物学会, 秘书长
2014-07-30-2017-09-01,国际微生物学会联盟真菌与真核微生物部执委, 秘书/财务
2013-09-01-今,国际酵母菌系统学和命名法委员会委员,
2011-03-31-今,Mycoscience, 编辑
2008-08-15-今,国际酵母菌委员会委员,
2000-12-31-2014-12-30,FEMS Yeast Research 编委,
